Webbläsaren som du använder stöds inte av denna webbplats. Alla versioner av Internet Explorer stöds inte längre, av oss eller Microsoft (läs mer här: * https://www.microsoft.com/en-us/microsoft-365/windows/end-of-ie-support).

Var god och använd en modern webbläsare för att ta del av denna webbplats, som t.ex. nyaste versioner av Edge, Chrome, Firefox eller Safari osv.

Porträttbild på Edith Hammer. Foto.

Edith Hammer

Universitetslektor

Porträttbild på Edith Hammer. Foto.

Quantification of growth and nutrient consumption of bacterial and fungal cultures in microfluidic microhabitat models

Författare

  • Carlos Arellano-Caicedo
  • Jason P. Beech
  • Martin Bengtsson
  • Pelle Ohlsson
  • Edith C. Hammer

Summary, in English

Understanding microbes in nature requires consideration of their microenvironment. Here, we present a protocol for quantifying biomass and nutrient degradation of bacterial and fungal cultures (Pseudomonas putida and Coprinopsis cinerea, respectively) in microfluidics. We describe steps for mask design and fabrication, master printing, polydimethylsiloxane chip fabrication, and chip inoculation and imaging using fluorescence microscopy. We include procedures for image analysis, plotting, and statistics. For complete details on the use and execution of this protocol, please refer to Arellano-Caicedo et al. (2023).1

Avdelning/ar

  • Biologiska institutionen
  • Fasta tillståndets fysik
  • Avdelningen för Biomedicinsk teknik

Publiceringsår

2024-03-15

Språk

Engelska

Publikation/Tidskrift/Serie

STAR Protocols

Volym

5

Issue

1

Dokumenttyp

Artikel i tidskrift

Förlag

Cell Press

Ämne

  • Microbiology

Nyckelord

  • Environmental sciences
  • Microbiology
  • Microscopy

Status

Published

ISBN/ISSN/Övrigt

  • ISSN: 2666-1667