Erik Clarkson

Om mig

Min utbildning på grund- och avancerad nivå är i teoretisk fysik vid Lunds universitet. Under mina examensarbeten har jag arbetat med att analysera experimentell data inom biofysik.

Om min forskning

Kvantitativa studier av biologiska processer är ofta tvärvetenskapliga i sin natur. I analysdelen av en sådan studie behövs simuleringar, modelleringar och beräkningar. Genom att förbättra beskrivningen av de bakomliggande processerna kan analysen optimeras. Med dessa metoder försöker jag uppskatta bindningsparametrarna hos T-cell receptorer från fluorescensmikroskopifilmer.

Det finns en rad utmaningar i den här analysen. Till exempel är det ovisst vilka spårade proteiner som är bundna respektive fria, hur kamerans slumpmässiga brus påverkar filmerna, och vilka fluorescensprickar som hör ihop från bild till bild. För att hitta de mest sannolika lösningarna på dessa problem gör jag sannolikhetsberäkningar i ett Bayesiskt ramverk.