Webbläsaren som du använder stöds inte av denna webbplats. Alla versioner av Internet Explorer stöds inte längre, av oss eller Microsoft (läs mer här: * https://www.microsoft.com/en-us/microsoft-365/windows/end-of-ie-support).

Var god och använd en modern webbläsare för att ta del av denna webbplats, som t.ex. nyaste versioner av Edge, Chrome, Firefox eller Safari osv.

Bild på Tobias Ambjörnsson

Tobias Ambjörnsson

Universitetslektor

Bild på Tobias Ambjörnsson

Bubble coalescence in breathing DNA: Two vicious walkers in opposite potentials

Författare

  • T. Novotny
  • Jonas Pedersen
  • T. Ambjörnsson
  • M. S. Hansen
  • R. Metzler

Summary, in English

We investigate the coalescence of two DNA bubbles initially located at weak segments and separated by a more stable barrier region in a designed construct of double-stranded DNA. The characteristic time for bubble coalescence and the corresponding distribution are derived, as well as the distribution of coalescence positions along the barrier. Below the melting temperature, we find a Kramers-type barrier crossing behaviour, while at high temperatures, the bubble corners perform drift-diffusion towards coalescence. The results are obtained by mapping the bubble dynamics on the problem of two vicious walkers in opposite potentials.

Avdelning/ar

  • Matematisk fysik

Publiceringsår

2007

Språk

Engelska

Publikation/Tidskrift/Serie

Europhysics Letters

Volym

77

Issue

4

Dokumenttyp

Artikel i tidskrift

Förlag

EDP Sciences

Ämne

  • Biophysics
  • Other Physics Topics

Status

Published

ISBN/ISSN/Övrigt

  • ISSN: 0295-5075