Webbläsaren som du använder stöds inte av denna webbplats. Alla versioner av Internet Explorer stöds inte längre, av oss eller Microsoft (läs mer här: * https://www.microsoft.com/en-us/microsoft-365/windows/end-of-ie-support).

Var god och använd en modern webbläsare för att ta del av denna webbplats, som t.ex. nyaste versioner av Edge, Chrome, Firefox eller Safari osv.

Porträttbild. Foto.

Carl Troein

Forskare

Porträttbild. Foto.

An introduction to BioArray software environment

Författare

  • Carl Troein
  • Johan Vallon-Christersson
  • Lao Saal

Summary, in English

BioArray Software Environment (BASE) is a web-based software package for storing, searching, and analyzing locally generated microarray data and information surrounding microarray production. The workflow begins in sample management and, optionally, microtiter plate tracking and ends in visualization and analysis of entire experiments. The relative ease with which new analysis plug-ins can be added has given rise to a plethora of third-party tools, and the licensing terms (GNU GPL) encourage local modifications of the software. This introduction to BASE describes the basics of working with the software, both in general and in more detail for the various parts. It also provides some hints about more advanced usage and a section on what is needed to set up your own BASE server. The information is current as of BASE version 1.2.17b, which was released on November 6, 2005.

Avdelning/ar

  • Beräkningsbiologi och biologisk fysik - Genomgår omorganisation
  • Bröstcancer-genetik

Publiceringsår

2006

Språk

Engelska

Sidor

99-119

Publikation/Tidskrift/Serie

Methods in Enzymology

Volym

411

Dokumenttyp

Artikel i tidskrift

Förlag

Academic Press

Ämne

  • Cancer and Oncology

Status

Published

ISBN/ISSN/Övrigt

  • ISSN: 0076-6879