Webbläsaren som du använder stöds inte av denna webbplats. Alla versioner av Internet Explorer stöds inte längre, av oss eller Microsoft (läs mer här: * https://www.microsoft.com/en-us/microsoft-365/windows/end-of-ie-support).

Var god och använd en modern webbläsare för att ta del av denna webbplats, som t.ex. nyaste versioner av Edge, Chrome, Firefox eller Safari osv.

Foto på Anders Irbäck

Anders Irbäck

Professor

Foto på Anders Irbäck

Finite-size shifts in simulated protein droplet phase diagrams

Författare

  • Daniel Nilsson
  • Anders Irbäck

Summary, in English

Computer simulation can provide valuable insight into the forces driving biomolecular liquid-liquid phase separation. However, the simulated systems have a limited size, which makes it important to minimize and control finite-size effects. Here, using a phenomenological free-energy ansatz, we investigate how the single-phase densities observed in a canonical system under coexistence conditions depend on the system size and the total density. We compare the theoretical expectations with results from Monte Carlo simulations based on a simple hydrophobic/polar protein model. We consider both cubic systems with spherical droplets and elongated systems with slab-like droplets. The results presented suggest that the slab simulation method greatly facilitates the estimation of the coexistence densities in the large-system limit.

Avdelning/ar

  • Beräkningsbiologi och biologisk fysik - Genomgår omorganisation
  • eSSENCE: The e-Science Collaboration

Publiceringsår

2021

Språk

Engelska

Publikation/Tidskrift/Serie

Journal of Chemical Physics

Volym

154

Issue

23

Dokumenttyp

Artikel i tidskrift

Förlag

American Institute of Physics (AIP)

Ämne

  • Other Physics Topics
  • Biophysics

Status

Published

ISBN/ISSN/Övrigt

  • ISSN: 0021-9606